O CEERMA está instalado numa edificação de 1.500 metros quadrados distribuídos em dois pavimentos com conceitos de acessibilidade desde sua entrada com rampa, banheiros adaptados e elevador para acesso ao pavimento superior. Todo o CEERMA possui uma ampla distribuição de rede lógica, telefonia, sistema de prevenção e combate a incêndio, vídeo câmeras de vigilância, duas redes de energia elétrica (110v e 220v) mais um sistema de Nobreak.
No pavimento térreo encontra-se um Auditório com capacidade para 80 pessoas, uma Sala de Pesquisa e Desenvolvimento para 40 pessoas, uma Sala de Colaboração Técnica Internacional e uma Sala de reunião. Ainda no térreo, além dos banheiros e vestiários também tem uma Área de Convivência equipada com copa, cozinha e almoxarifado. No pavimento superior está situado a Sala da Coordenação, Administrativa e dos Pesquisadores lotados no CEERMA. Nesse pavimento também estão localizados os dois principais núcleos operacionais: Aplicações Computacionais de Alto Desempenho e Aplicações Colaborativas Remotas e de Realidade Virtual.
O núcleo de Aplicações Computacionais de Alto Desempenho é composto pelo HPC (High-Performance Computing) e pelo CPD (Centro de Processamento de Dados). O sistema de processamento é do tipo distribuído e/ou paralelo que interliga vários nós de processamento de maneira que um processo de grande consumo seja executado no nó mais disponível ou mesmo subdividido por vários nós. O supercomputador conta ainda com um sistema de armazenamento de dados com capacidade de 48 Terabytes (1 TB equivale a 1024GB), com uma rede InfiniBand além de um sistema de processamento paralelo NVIDIA CUDA. Com essa tecnologia o CEERMA realiza o processamento dos seus códigos-fonte com rapidez e armazena os dados obtidos com segurança.
O núcleo de Aplicações Colaborativas Remotas e de Realidade Virtual é formado pela Sala de Trabalho Colaborativo Remoto e pela Caverna Digital também chamada de CAVE (Cave Automatic Virtual Environment). A Sala de Trabalho Colaborativo Remoto foi concebida com base no conceito I.C.E. (Interactive Collaborative Environment), com o objetivo de interagir virtualmente e instantaneamente com outros pesquisadores espalhados pelo Brasil e pelo mundo. O ambiente integrado possui capacidade presencial de 10 participantes mais a colaboração remota simultânea com até 10 locais diferentes permitindo a todos a utilização das diversas funcionalidades locadas no CEERMA. A sala está equipada com um quadro interativo inteligente (Smartboard) e uma a tela de projeção 3D, além de facilitar uma rápida troca de dados entre todos os participantes do ambiente. A Caverna Digital ou CAVE é um sistema de projeção imersivo 3D que proporciona a imersão total do usuário dentro de um ambiente virtual. A CAVE instalada no CEERMA possui quatro telas, oito projetores com espelhos, sistema de rastreamento com quatro câmeras e softwares que possibilitam ao pesquisador realizar trabalhos com modelos e aplicativos 3D.
