Resumo:
Trata-se de uma ferramenta para análise e dados de ciências ômicas (genômica, transcriptômica, proteômica, etc.), envolvendo Big Data. Foi desenvolvida uma ferramenta que permite a visualização de dados por meio de interface gráfica, o que viabiliza sua rápida interpretação. Esta ferramenta surge a partir do TrinotateWeb, um software baseado em comunidades abertas, onde contribuições e modificações do seu código são permitidas e incentivadas. Em termos de função, o GETView propõe otimizar as formas de visualizar e analisar informações de expressão, bem como de anotação gênica, utilizando a linguagem PHP, associada com os recursos da biblioteca em Javascript CanvasXpress e Python. O programa permite a inserção de diversas informações em seu banco de dados, além de auxiliar na filtragem de tabelas com milhares/molhões de informações. Dispõe de recursos de visualização de dados de expressão gênica em heatmaps, além de ser possível o input de dados não previamente depositados na plataforma, permitindo a fácil manipulação de diversos conjuntos de dados. Além disso, o tempo de análise é otimizado, visto que as análises poderão ser direcionadas para um conjunto maior de dados. Para explorar as diferentes formas de visualização o usuário pode inserir dados de expressão em formato “.tsv”, o que lhe permite gerar heatmaps (mapas de calor) interativos dentro dos parâmetros escolhidos. Todos os gráficos de heatmap gerados na plataforma desenvolvida são passíveis de download e manipulação pelo usuário para um conjunto maior de dados. Assim, a proposta desenvolvida permite diferentes formas de visualização de dados aos usuários visando tornar mais simples por meio de interface gráfica a análise de expressão diferencial dos genes e/ou proteínas, tornando-se um importante recurso para análises de ciências ômicas.
Solução Proposta:
O programa permite a inserção de diversas informações em seu banco de dados, além de auxiliar na filtragem de tabelas com milhares de informações, dispondo ainda de recursos diferenciados de visualização de dados de expressão gênica com qualidade maior que outras ferramentas, gerando heatmaps, além de ser possível o input de dados não previamente depositados na plataforma. O tempo de análise é otimizado, visto que as análises poderão ser direcionadas para um conjunto maior de dados. Para explorar as diferentes formas de visualização o usuário pode inserir dados de expressão.
Autores:
Gabriel Augusto Fabricio Bezerra; Flávia Figueira Aburjaile; João Pacifico Bezerra Neto; Rommel Thiago Jucá Ramos; Fabrício Almeida Araújo e Ana Maria Benko Iseppon.
Propriedade Intelectual:
Registro INPI: BR 512021000584-8
Objetivo da UFPE:
Licenciamento ou Parceria para Desenvolvimento
Contato:
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